Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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