Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cdca8Q8BHX3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdca8Q8BHX3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms