Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem39bQ810L4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms