Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Smim19Q80ZU4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms