Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZT1

1700001K19Rik, MCG11474, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001K19RikQ80ZT1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001K19RikQ80ZT1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms