Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pcsk9Q80W65 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms