Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnphQ80U23 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnphQ80U23 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms