Protein–RNA interactions for Protein: Q80U22

Rusc2, Iporin, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc2Q80U22 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rusc2Q80U22 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rusc2Q80U22 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms