Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pja2Q80U04 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms