Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2q1Q7TSS2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms