Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctdp1Q7TSG2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctdp1Q7TSG2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms