Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms