Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Actn1Q7TPR4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms