Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno2Q7TNB8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms