Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf139Q7TMV1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf139Q7TMV1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf139Q7TMV1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf139Q7TMV1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rnf139Q7TMV1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf139Q7TMV1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms