Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Sys1Q78S06 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Sys1Q78S06 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sys1Q78S06 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Sys1Q78S06 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Sys1Q78S06 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Sys1Q78S06 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sys1Q78S06 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms