Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnot1Q6ZQ08 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms