Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Glis3Q6XP49 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms