Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms