Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Krt9Q6RHW0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Krt9Q6RHW0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt9Q6RHW0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms