Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasa4Q6PFQ7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa4Q6PFQ7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms