Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rad54bQ6PFE3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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