Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf2Q6P9P0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms