Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmgb4Q6P8W9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgb4Q6P8W9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms