Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Asic1Q6NXK8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms