Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mvb12bQ6KAU4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms