Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms