Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Pkp4Q68FH0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkp4Q68FH0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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