Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kiaa1549Q68FD9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Kiaa1549Q68FD9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms