Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sbno1Q689Z5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sbno1Q689Z5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sbno1Q689Z5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sbno1Q689Z5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sbno1Q689Z5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sbno1Q689Z5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sbno1Q689Z5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sbno1Q689Z5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Sbno1Q689Z5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sbno1Q689Z5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sbno1Q689Z5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sbno1Q689Z5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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