Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ctnna3Q65CL1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctnna3Q65CL1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms