Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Top2bQ64511 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Top2bQ64511 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms