Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Vat1Q62465 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms