Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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