Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sall3Q62255 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sall3Q62255 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms