Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Six2Q62232 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Six2Q62232 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Six2Q62232 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Six2Q62232 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Six2Q62232 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Six2Q62232 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Six2Q62232 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Six2Q62232 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Six2Q62232 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Six2Q62232 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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