Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ssr4Q62186 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ssr4Q62186 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ssr4Q62186 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ssr4Q62186 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ssr4Q62186 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ssr4Q62186 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ssr4Q62186 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssr4Q62186 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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