Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sin3bQ62141 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms