Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Odf1Q61999 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms