Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ecm1Q61508 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ecm1Q61508 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms