Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msi1Q61474 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msi1Q61474 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms