Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcd2Q61285 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms