Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PapolaQ61183 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PapolaQ61183 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms