Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cln3Q61124 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cln3Q61124 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cln3Q61124 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cln3Q61124 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cln3Q61124 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cln3Q61124 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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