Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nab1Q61122 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms