Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxd3Q61060 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Foxd3Q61060 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms