Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp4Q60972 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms