Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grik1Q60934 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grik1Q60934 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms