Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sema5bQ60519 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sema5bQ60519 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms