Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tdrd5Q5VCS6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tdrd5Q5VCS6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms